Cerita di awali dengan focus terhadap Sel Darah Merah yang baru saja bekerja di dalam tubuh dan mengantarkan nutrisi serta oksige. Ketika itu, ia bertemu dengan Sel Darah Putih yang memiliki tugas untuk membasmi para bakteri yang masuk ke tubuh manusia.
Berbeda dengan Hataraku Saibou, versi Black dari anime ini berfokus kepada tubuh manusia dengan gaya hidup yang tidak sehat. Tentu, setiap Sel yang ada harus berjuang dan mengembang tugas yang begitu berat mengingat mereka berhadap dengan bakteri yang sangat kuat.
Mampukah setiap sel mempertahankan tubuh ini agar tidak berdampak parah? Akankah seluruh sel-sel di dalam tubuh ini bekerja sama dan membuat keadaan menjadi lebih baik?