Bercerita tentang seorang siswa bernama Hasegawa Kodaka, ia baru saja pindah ke sekolah barunya namun sudah mendapat reputasi layaknya seorang berandalan. Hal itu karena warna rambutnya yang bercampur dengan warna hitam dan pirang miliknya.
Karena serangkaian kejadian dan beberapa faktor lainnya membuat ia sangat susah mencari teman dan bergaul dengan orang-orang lainnya. Suatu hari ia melihat teman sekelasnya, Mikazuki Yozora sedang berbicara dengan teman khayalannya. Hasegawa menyadari walaupun Yozora memiliki sifat yang kasar ternyata ia sama seperti dirinya yang susah untuk mendapatkan teman.
Sejak saat itu ia mereka berduapun kini membuat sebuah klub pertemanan yang bertujuan untuk mendapatkan teman dan mulai kini mereka akan merekrut anggota baru.
Tonton juga kelanjutannya, Boku wa Tomodachi ga Sukunai Next.