Anime ini bercerita tentang seorang gadis bernama Atsuko Kagari (Akko). Waktu kecil, ia pernah melihat pertunjukan sihir “Magical Festa” yang ditampilkan oleh seorang penyihir terkenal Shiny Chariot. Akko sangat terpukau serta mengidolakan Shiny dan sejak saat itu Akko bercita-cita agar menjadi penyihir hebat seperti Shiny Chariot.

Saat memasuki masa remaja, Akko memberanikan diri untuk mendaftar ke sebuah sekolah sihir di Luna Nova Magical Academy. Walaupun Akko hanya manusia biasa tanpa memiliki latar belakang keluarga magis hal tersebut tak menghentikan dirinya. Bahkan dalam perjalanan hari pertamanya menuju akademi sama sekali tak mulus. Ia harus menaiki sapu terbang yang hanya dapat dinaiki oleh penyihir dan hal lain sebagainya.

Ia juga bertemu dengan teman barunya Lotte Yansson yang pemalu & Sucy Manbavaran yang sarkastik, serta saingannya barunya Diana Cavendish yang cantik dan berbakat.

Dengan berbekal tongkat milik Chariot, Shiny Rod, yang Akko dapati saat perjalanan ke Akademi. Akankah Akko dapat menjadi penyihir yang hebat seperti yang ia impikan? Bagaimanakah kisah selanjutnya?