Takezou Kurata merupakan anggota terakhir klub koto. Klub Koto merupakan klub alat musik petik tradisional Jepang.

Karena kakak kelas mereka akan segera lulus maka hanya tinggal Takezou seorang yang menjadi anggota klub tersebut. Tahun ajaran barupun dimulai, Takezou harus mempersiapkan dirinya untuk mencari anggota baru, karena kalau tidak ada anggota baru yang masuk, maka klub Koto harus dibubarkan.

Dan ada seorang yang tiba-tiba menerobos klub dan menyatakan kalau dirinya akan mendaftar ke klub koto. Awalnya Takezou tak percaya karena sang pendaftar adalah Chika Kudou, seorang preman yang ditakuti disekolahnya bahkan di sekolah lain karena kasus yang menimpanya.

Namun, setelah beberapa peristiwa menimpa dirinya beserta klub koto yang diselamatkan oleh Chika, akhirnya Takezou menerimanya sebagai anggota baru. Bagaimanakah kisah baru mereka di klub Koto?

Tonton juga kelanjutannya, Kono Oto Tomare! Season 2.