Mengisahkan seorang pria atau remaja bernama Ganta Nakami dan gadis cantik bernama Isaki Magari. Keduanya memiliki banyak sekali perbedaan. Namun yang pasti, keduanya menderita Insomnia atau biasa dikenal dengan Gangguan Tidur.

Setiap harinya, Ganta dan Isaki selalu khawatir terhadap Insomnia yang mereka idap. Setelah sepulang sekolah, mereka sering bertemu di sebuah Observatorium yang kini menjadi gudang. Di sana, Ganta dan Isaki berbagi rahasia hingga sebuah hal terjadi.