Suatu hari Kaname Sudou diinvite oleh temannya dari sebuah game misterius yang bernama Darwin’s Game, sebuah aplikasi game smartphone yang belum pernah ia mainkan.

Tanpa mengetahui apapun tentang game tersebut akhirnya waktu mundur dalam game otomatis berjalan. Hingga tiba waktunya game tersebut memberitahukan bahwa Kaname harus bertarung melawan seseorang. Awalnya Kaname menghiraukan pemberitahuan tersebut, namun hingga waktunya seseorang menyerang dirinya. Memulai game mematikan ini.

Tak ada tulisan logout ataupun berhenti dari game, mereka harus menyelesaikan game mematikan ini, siapapun yang kehabisan point maka ia akan mati dan lenyap dari dunia ini, untuk mendapatkan point mereka harus bertarung satu sama lain dan memenangkan pertandingan, terlebih lagi setiap pemain diberikan sebuah kemampuan khusus yang disebut dengan Sigil.

Setiap pemain memiliki Sigilnya masing-masing, apakah yang akan terjadi kepada Kaname di dalam game hidup dan mati ini.